Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd27Q3UMR0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ankrd27Q3UMR0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms