Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smu1Q3UKJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smu1Q3UKJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smu1Q3UKJ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smu1Q3UKJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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