Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef1Q3UHC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rapgef1Q3UHC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rapgef1Q3UHC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef1Q3UHC1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef1Q3UHC1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef1Q3UHC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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