Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trip13Q3UA06 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip13Q3UA06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip13Q3UA06 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms