Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtpbp6Q3U6U5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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