Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U6N9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3U6N9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3U6N9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3U6N9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U6N9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U6N9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U6N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U6N9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3U6N9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms