Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gse1Q3U3C9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gse1Q3U3C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gse1Q3U3C9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gse1Q3U3C9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gse1Q3U3C9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gse1Q3U3C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms