Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LcorlQ3U285 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LcorlQ3U285 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms