Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tbc1d2bQ3U0J8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tbc1d2bQ3U0J8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms