Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TchpQ3TVW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TchpQ3TVW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TchpQ3TVW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TchpQ3TVW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TchpQ3TVW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms