Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt2Q3TTY5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt2Q3TTY5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt2Q3TTY5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms