Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CiartQ3TQ03 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CiartQ3TQ03 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CiartQ3TQ03 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CiartQ3TQ03 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CiartQ3TQ03 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms