Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Eepd1Q3TGW2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Eepd1Q3TGW2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eepd1Q3TGW2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eepd1Q3TGW2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms