Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc127Q3TC33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc127Q3TC33 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc127Q3TC33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc127Q3TC33 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms