Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M3Q31093 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M3Q31093 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M3Q31093 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms