Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Shroom4Q1W617 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Shroom4Q1W617 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Shroom4Q1W617 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Shroom4Q1W617 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Shroom4Q1W617 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Shroom4Q1W617 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Shroom4Q1W617 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Shroom4Q1W617 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
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