Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc138Q0VF22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc138Q0VF22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc138Q0VF22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms