Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmntd2Q0VET5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmntd2Q0VET5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmntd2Q0VET5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmntd2Q0VET5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmntd2Q0VET5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmntd2Q0VET5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmntd2Q0VET5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmntd2Q0VET5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmntd2Q0VET5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms