Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem52bQ0VBF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem52bQ0VBF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem52bQ0VBF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem52bQ0VBF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms