Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h18Q0P678 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h18Q0P678 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zc3h18Q0P678 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zc3h18Q0P678 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zc3h18Q0P678 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms