Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Znf541Q0GGX2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Znf541Q0GGX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Znf541Q0GGX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Znf541Q0GGX2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Znf541Q0GGX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms