Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pate4Q09098 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pate4Q09098 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pate4Q09098 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms