Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssrp1Q08943 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssrp1Q08943 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ssrp1Q08943 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssrp1Q08943 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms