Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Runx2Q08775 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Runx2Q08775 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Runx2Q08775 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Runx2Q08775 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms