Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp2Q08652 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbp2Q08652 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp2Q08652 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbp2Q08652 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp2Q08652 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms