Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MestQ07646 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MestQ07646 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MestQ07646 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MestQ07646 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MestQ07646 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MestQ07646 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MestQ07646 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
MestQ07646 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MestQ07646 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MestQ07646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MestQ07646 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MestQ07646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MestQ07646 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MestQ07646 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MestQ07646 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MestQ07646 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MestQ07646 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MestQ07646 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MestQ07646 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MestQ07646 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MestQ07646 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MestQ07646 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MestQ07646 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MestQ07646 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MestQ07646 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MestQ07646 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MestQ07646 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MestQ07646 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MestQ07646 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MestQ07646 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MestQ07646 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MestQ07646 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MestQ07646 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MestQ07646 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MestQ07646 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MestQ07646 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MestQ07646 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MestQ07646 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MestQ07646 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MestQ07646 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MestQ07646 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MestQ07646 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MestQ07646 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MestQ07646 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MestQ07646 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MestQ07646 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MestQ07646 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MestQ07646 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MestQ07646 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MestQ07646 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MestQ07646 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MestQ07646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MestQ07646 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MestQ07646 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MestQ07646 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MestQ07646 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MestQ07646 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MestQ07646 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms