Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col9a2Q07643 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a2Q07643 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col9a2Q07643 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col9a2Q07643 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms