Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms