Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf9Q07105 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf9Q07105 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdf9Q07105 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf9Q07105 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf9Q07105 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms