Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrstQ06666 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrstQ06666 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrstQ06666 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrstQ06666 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrstQ06666 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrstQ06666 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrstQ06666 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrstQ06666 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrstQ06666 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrstQ06666 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrstQ06666 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrstQ06666 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrstQ06666 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrstQ06666 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrstQ06666 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrstQ06666 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms