Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Mex3cQ05A36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mex3cQ05A36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mex3cQ05A36 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mex3cQ05A36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mex3cQ05A36 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mex3cQ05A36 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Mex3cQ05A36 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms