Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccl7Q03366 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccl7Q03366 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccl7Q03366 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl7Q03366 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms