Protein–RNA interactions for Protein: P98086

C1qa, Complement C1q subcomponent subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qaP98086 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qaP98086 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qaP98086 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qaP98086 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qaP98086 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qaP98086 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qaP98086 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1qaP98086 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qaP98086 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1qaP98086 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qaP98086 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1qaP98086 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1qaP98086 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1qaP98086 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1qaP98086 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1qaP98086 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C1qaP98086 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1qaP98086 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1qaP98086 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1qaP98086 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1qaP98086 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1qaP98086 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1qaP98086 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1qaP98086 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1qaP98086 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1qaP98086 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1qaP98086 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms