Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbbp6P97868 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbbp6P97868 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbbp6P97868 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbbp6P97868 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbbp6P97868 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbbp6P97868 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms