Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps45P97390 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps45P97390 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps45P97390 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps45P97390 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps45P97390 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps45P97390 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps45P97390 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps45P97390 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps45P97390 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps45P97390 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms