Protein–RNA interactions for Protein: P83882

Rpl36a, 60S ribosomal protein L36a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36aP83882 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl36aP83882 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl36aP83882 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl36aP83882 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms