Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh9P70407 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh9P70407 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdh9P70407 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdh9P70407 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh9P70407 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms