Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn1P70268 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn1P70268 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn1P70268 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn1P70268 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn1P70268 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkn1P70268 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms