Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxna3P70208 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plxna3P70208 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Plxna3P70208 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plxna3P70208 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms