Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Smg6P61406 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smg6P61406 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smg6P61406 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Smg6P61406 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smg6P61406 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Smg6P61406 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smg6P61406 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Smg6P61406 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Smg6P61406 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Smg6P61406 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Smg6P61406 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smg6P61406 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smg6P61406 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Smg6P61406 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Smg6P61406 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smg6P61406 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Smg6P61406 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Smg6P61406 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Smg6P61406 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smg6P61406 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Smg6P61406 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms