Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2fP61219 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2fP61219 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2fP61219 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2fP61219 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2fP61219 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2fP61219 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2fP61219 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2fP61219 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms