Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Anks1aP59672 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Anks1aP59672 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Anks1aP59672 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Anks1aP59672 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Anks1aP59672 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms