Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CgnP59242 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CgnP59242 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CgnP59242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CgnP59242 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CgnP59242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CgnP59242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CgnP59242 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CgnP59242 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CgnP59242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CgnP59242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CgnP59242 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CgnP59242 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CgnP59242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CgnP59242 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CgnP59242 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CgnP59242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CgnP59242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CgnP59242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CgnP59242 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CgnP59242 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CgnP59242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CgnP59242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CgnP59242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CgnP59242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CgnP59242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CgnP59242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CgnP59242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CgnP59242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CgnP59242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CgnP59242 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CgnP59242 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CgnP59242 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CgnP59242 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CgnP59242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CgnP59242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CgnP59242 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CgnP59242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CgnP59242 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CgnP59242 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CgnP59242 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CgnP59242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CgnP59242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CgnP59242 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CgnP59242 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CgnP59242 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CgnP59242 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CgnP59242 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CgnP59242 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CgnP59242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CgnP59242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CgnP59242 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CgnP59242 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CgnP59242 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CgnP59242 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CgnP59242 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CgnP59242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CgnP59242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CgnP59242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CgnP59242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CgnP59242 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CgnP59242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CgnP59242 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CgnP59242 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CgnP59242 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CgnP59242 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CgnP59242 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CgnP59242 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CgnP59242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CgnP59242 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CgnP59242 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CgnP59242 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CgnP59242 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CgnP59242 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CgnP59242 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CgnP59242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CgnP59242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CgnP59242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CgnP59242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms