Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc3P59034 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc3P59034 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc3P59034 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc3P59034 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc3P59034 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms