Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Exosc10P56960 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Exosc10P56960 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Exosc10P56960 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Exosc10P56960 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Exosc10P56960 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Exosc10P56960 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms