Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TdgP56581 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TdgP56581 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TdgP56581 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TdgP56581 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TdgP56581 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TdgP56581 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TdgP56581 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TdgP56581 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TdgP56581 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TdgP56581 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TdgP56581 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TdgP56581 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TdgP56581 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TdgP56581 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TdgP56581 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TdgP56581 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TdgP56581 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TdgP56581 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TdgP56581 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TdgP56581 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TdgP56581 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TdgP56581 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TdgP56581 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TdgP56581 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TdgP56581 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TdgP56581 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TdgP56581 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TdgP56581 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TdgP56581 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TdgP56581 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TdgP56581 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TdgP56581 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TdgP56581 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TdgP56581 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TdgP56581 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TdgP56581 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TdgP56581 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TdgP56581 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TdgP56581 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TdgP56581 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TdgP56581 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TdgP56581 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TdgP56581 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TdgP56581 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TdgP56581 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TdgP56581 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TdgP56581 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TdgP56581 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TdgP56581 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TdgP56581 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TdgP56581 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TdgP56581 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TdgP56581 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TdgP56581 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TdgP56581 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TdgP56581 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TdgP56581 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TdgP56581 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TdgP56581 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TdgP56581 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TdgP56581 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms