Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckbrP56481 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CckbrP56481 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CckbrP56481 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CckbrP56481 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CckbrP56481 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CckbrP56481 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CckbrP56481 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms