Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pms2P54279 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pms2P54279 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pms2P54279 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pms2P54279 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pms2P54279 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pms2P54279 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pms2P54279 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pms2P54279 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pms2P54279 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms