Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stmn1P54227 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stmn1P54227 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stmn1P54227 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stmn1P54227 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stmn1P54227 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms