Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RabggtbP53612 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RabggtbP53612 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RabggtbP53612 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtbP53612 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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