Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Map3k1P53349 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Map3k1P53349 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Map3k1P53349 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Map3k1P53349 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Map3k1P53349 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Map3k1P53349 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Map3k1P53349 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Map3k1P53349 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Map3k1P53349 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Map3k1P53349 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Map3k1P53349 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Map3k1P53349 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms